نتیجه اولیه آزمون سراسری سال ۹۸ روز سه‌شنبه ۱۵ مرداد ۹۸ به صورت کارنامه، روی پایگاه اطلاع‌رسانی سازمان سنجش آموزش کشور قرار گرفت و آن دسته از داوطلبانی که مجاز به انتخاب رشته‌های تحصیلی "پذیرش با آزمون" شدند، لازم است برای انتخاب رشته، دفترچه راهنمای انتخاب رشته‌های تحصیلی (شماره ۲) آزمون سراسری سال ۱۳۹۸ را مطالعه کرده و مراحل انتخاب رشته را انجام دهند.
دفترچه راهنمای انتخاب رشته‌های تحصیلی (دفترچه شماره ۲) هر یک از گروه‌های آزمایشی مربوط (شامل رشته های پذیرش با آزمون) نیز از روز پنجشنبه ۱۷ مرداد ۹۸ بر روی سایت سازمان سنجش قرار داده شدو هر یک از داوطلبان گروه‌های آزمایشی علوم ریاضی و فنی، علوم تجربی، علوم انسانی، هنر و یا زبان های خارجی که مجاز به انتخاب رشته شده‌اند، می‌توانند دفترچه راهنمای انتخاب رشته گروه آزمایشی ذیربط را از طریق سایت سازمان سنجش دریافت کنند
سامانه راهنمای انتخاب رشته مجازی مربوط به رشته محل های با آزمون «گروه علوم تجربی» بر روی سایت سازمان سنجش آموزش کشور منتشر شده و سامانه راهنمای انتخاب رشته مجازی مربوط به رشته محل های با آزمون «گروه ریاضی و فنی»، «گروه هنر» و «گروه زبان های خارجی» نیز ساعت ۲۲ امشب شنبه ۱۹ مرداد بر روی سایت این سازمان فعال می‌شود.
بر اساس اعلام سازمان سنجش آموزش کشور، داوطلبان مجاز به انتخاب رشته از فردا ۲۰ تا ۲۴ مرداد ماه فرصت دارند نسبت به انتخاب رشته اقدام کنند. در واقع هر داوطلب می‌تواند در سیستم انتخاب رشته مجازی با هزینه ۷۵ هزار ریال (۷ هزار و ۵۰۰ تومان) تا ۲۵۰ کدرشته انتخابی را با توجه به رتبه و نمره در زیر گروه ها و سهمیه ها انتخاب کند و شانس قبولی خود را بررسی کند.
همچنین انتخاب رشته در رشته های بدون آزمون (پذیرش با سوابق تحصیلی) نیز از ۱۷ اسفند ۹۷ آغاز شده است و تا ۲۸ شهریور ۹۸ ادامه دارد. برخی از دانش آموزان که تاکنون نمرات خود را دریافت نکرده بودند نیز اکنون می‌توانند در فرآیند انتخاب رشته شرکت کنند. امکان انتخاب ۱۰۰ کدرشته محل در رشته های بدون آزمون وجود دارد.
داوطلبانی که در زمان ثبت نام و انتخاب رشته،دانشگاه‌های پیام نور و غیرانتفاعی ها را انتخاب نکرده اند، نیز می توانند در صورت مجاز بودن، پس از پرداخت وجه مورد نیاز، رشته های مرتبط با این مراکز را انتخاب کنند و انتخاب رشته در دانشگاه های فرهنگیان و تربیت دبیر شهید رجایی بر اساس ضوابط اعلام شده صورت می‌گیرد.
در کنکور سال ۹۸ پذیرش به صورت نیمه متمرکز وجود ندارد و تنها رشته‌های با شرایط خاص از جمله هنر و علوم ورزشی دارای بخش عملی هستند اما پذیرش به صورت متمرکز خواهد بود.
انتخاب رشته های دانشگاه آزاد از ۲۰ مرداد آغاز می شود و داوطلبان باید به سایت مرکز سنجش دانشگاه آزاد مراجعه کرده و با استفاده از کد ۷ رقمی قید شده در انتهای کارنامه، در فرآیند جداگانه انتخاب رشته دانشگاه آزاد شرکت کنند.
